《滇游日记二》至《滇游日记十三》共１２篇。
２至３篇大致记录其在云南东部、东南部地区的游历，游记４为中部、西南部部分地区的游历，５至８篇为西、西北部之游历，９篇以后则为西南部集中记游。
《滇游日记》是徐霞客遗留下的文字中最丰富的部分，对云南风物、山川、特产、民俗等等的记叙最为详细。记游可分为几大版块：东、东南部以滇池、碧鸡山、颜洞、盘江为其重点，并著有《盘江考》专篇。中部仍以滇池为轴反复考察其水系山脉。西、西北部以洱海、点苍山（亦名苍山）、鸡足山为中心，向西北延伸至丽江、解脱林。
西南之游由大理西南，至永昌，至腾冲，跨越澜沧江、枯柯河、潞江、龙川江等水系。
《游记》后有《鸡山志目》和《鸡山志略》一、二，对鸡山之景观一一列出，并皆有说明，文笔点化甚精。
其后又列有《丽江纪略》和《法王缘起》二篇。
最后，特别值得一提的是《溯江纪源》。徐霞客经过自己精密的考察和大胆的推测，主要辨析了我国两条最大的河流长江和黄河的发源、流域情况。
同时对其水系也进行了较为详尽的考察与说明，澄清了在此以前的种种误说与妄说，已具有了相当高的科学价值。
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