而波导之力在他们战斗之时完完全全是作为旁观者的存在，他逐渐地发展自己，由原来似乎是没有灵智的一团能量而渐渐像初代阿尔宙斯和光之神龙他们一样产生了自己的灵智，只不过这种灵智还十分微弱，让这时候在闭关恢复的其他三位一点都没感应出来。
又过了不知多少年，原暗的伤养好了，碍于其性格问题，它又开始挑衅光之神龙和初代阿尔宙斯。而初代阿尔宙斯和光之神龙也并不是会忍气吞声之辈，便又开始和原暗打起来，这也就是秘古时期的第二次大战。只不过这次的战斗和上次一样，依然是一边倒。这次原暗被虐得比上次还惨。然而，有了上次的教训，初代阿尔宙斯和光之神龙便不存在抹杀原暗的心思，只是想将其封印，以绝后患。只不过这种举动引起了原暗的强烈反扑，它甚至动用了这个宇宙的属于它的那部分的本源之力。初代阿尔宙斯和光之神龙见此也动用了属于它们部分的宇宙的本源之力。但这个样子毫无顾忌地使用宇宙本源之力会导致这个宇宙的崩塌和破灭，破坏了天道的规则，于是未知图腾又插手了进来。它用自己的本身中的一道道法则之力来限制他们三个对于宇宙本源的使用。
然而这种限制对于他们来说只是徒劳无用而已，暴怒的他们依然在打着，宇宙依然在渐渐崩溃着。这时，波导之力发出了耀眼的光芒，凝聚出了一具十分虚的但又是真实存在形体。这个形体之中好像还存在这一团光亮，但谁也不清楚那是什么。那具形体突然就对着原暗用了一招，原暗被打了个措手不及，就陷入了彻底的虚弱状态。然后这具形体就先取出未知图腾身中的大部分法则之力，并以初代阿尔宙斯，原暗和光之神龙的本源力量，以自身的能量为基础制造了一个封印阵，将原暗封印其中。并用剩下来的力量阻止了宇宙的崩溃，还用剩下的未知图腾的法则铸造了“a~z”26个未知图腾支撑着天道的运行。初代阿尔宙斯也反映过来了，它将混沌分解成17种元素之力，升华了世间的万物，并以自己的百分之一的力量做出了自己的几个分身来代替其执掌混沌，然后陷入了沉睡之中。光之神龙以希望的力量加固了宇宙的外壁，创造了宇宙中的灵魂，并将自己所掌有的最强的希望之光封印在了一个星球中。再以自己身体为蓝本遗留三分的力量在了其中的一个最具有生命力的星球上（也就是神奇宝贝的世界）等待继承，然后自我将自己的肉身封印在一座塔之中留下一点点灵力。接下来它的灵体就在宇宙中游荡着，慢慢恢复着自己在惨烈的第二次大战中所受的伤痛。宇宙因为此又陷入了一个平静的状态。在这个封印阵中因为有了所有创造生命的力量，经过时间的推移那个不能算作形体的形体就渐渐变化成为了一个具有极高智慧的生命。
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